Abgesehen von einigen Repertorien (→Archivrepertorien) zu seinen Archivaliensammlungen gibt der Historische Verein vor allem die „Verhandlungen des Historischen Vereins für Oberpfalz und Regensburg“ (→Verhandlungen) heraus, die schon seit 1831 kontinuierlich erscheinen. Die darin enthaltenen Beiträge bilden eine wichtige Grundlage der historischen Forschung für Regensburg, die Oberpfalz und ganz Bayern. Zwischen 1926 und 2004 wurde auch die Oberpfalzbibliographie (→Bibliographien) im Rahmen dieser wissenschaftlichen Fachzeitschrift abgedruckt. Seit 2013 unterstützt der Historische Verein ein open-access-Publikationsportal zur regionalen Heimatforschung in Ostbayern (→E-Publikationen).